Bonjour

Je suis professeur régulier à l’Université du Québec à Montréal, travaillant principalement en bioinformatique. Mes principaux intérêts de recherche sont la bioinformatique, principalement liée à l’ARN et au microbiome humain, l’intelligence artificielle, et les jeux de science participative.

J’ai complété mon doctorat en 2024 sous la supervision de Jérôme Waldispühl et Vladimir Reinharz.

Ma recherche sur l’ARN se concentre sur les approches algorithmiques et statistiques pour modéliser et prédire la structure 3D de l’ARN, avec un accent sur la prédiction de sous-structures spécifiques appelées modules 3D de l’ARN. Mon travail le plus récent exploite l’échantillonnage de structures secondaires et le couplage de boucles basé sur la taille avec des bases de données.

Mon travail en science participative se concentre sur le développement d’un jeu de crowd-computing pour l’analyse à grande échelle des données de séquence d’ARN. Ce jeu a été implémenté dans Borderlands Science. Dans ce mini-jeu de Borderlands 3, vous pouvez recevoir des récompenses pour avoir joué à un jeu de puzzle. Nous avons collecté plus de 130 millions de solutions de plus de 4 millions de joueurs pour améliorer notre compréhension des relations évolutives entre les microbes intestinaux. Article dans Nature Biotechnology.

Note: la version bilingue de ce site est présentement en construction.

Hi

I am a professor at the Université du Québec à Montréal, working primarily in bioinformatics. My main research interests are computational biology, mostly related to RNA and the human microbiome, artificial intelligence, and citizen science games.

I completed my doctorate in 2024 under the supervision of Jérôme Waldispühl and Vladimir Reinharz.

My RNA research focuses on algorithmic and statistical approaches to modeling and predicting RNA 3D structure, with a focus on the prediction of specific substructures named RNA 3D modules. My most recent work leverages secondary structure sampling and size-based loop-matching to databases.

My citizen science work focuses on developing a crowd-computing game for large-scale analysis of RNA sequence data. This game has been implemented in Borderlands Science. In this mini-game within Borderlands 3, you can receive loot for playing a puzzle game. We have collected over 130 million solutions from over 4 million players to improve our understanding of evolutionary relationships between gut microbes. Nature Biotechnology article.